在电视剧《御赐小仵作》里面，萧瑾瑜的真实身世究竟是什么暂时还没有被播出，不过很多人猜测他要不然是当年叛党陈璎的儿子，要不然就是皇帝的亲外甥，也就是说他是昌王的儿子。之所以会这样说，是因为萧瑾瑜和他的哥哥两个人长得并不相似，楚楚第一次见到萧瑾瑜的时候，就发出了这样的感慨。
随着剧情的播出，萧瑾瑜的身份基本被确定了下来，他和皇帝之间应该是有着血缘关系的，不过不知道他到底是哪一位王的儿子。最后他应该不会是陈璎的孩子，因为楚楚的身份已经明了，她是当年叛党陈璎的孩子，不过因为她的母亲逃了出来，所以楚楚才得以在其他人家快乐的长大。
在最后的大结局里面，萧瑾瑜和楚楚两个人也收获了一个比较完美的结局，萧瑾瑜一直都想要弄清自己父亲萧恒死亡的真相，从公主对他的态度中可以看得出来，他和公主二人之间应该有着一定的关系，甚至可以说他的父母应该是公主的救命恩人，所以公主才宁愿舍弃自己的亲生儿子，去保护萧瑾瑜长大。
从公主的眼神中可以看得出来，萧瑾璃应该是公主的新生儿子，不过最后爵位却让萧瑾瑜来继承了，原因有很多。第一点就是萧瑾瑜曾经不顾自己的性命去救过萧瑾璃，这让萧瑾璃一直对他抱有愧疚的心理，所以他希望自己的弟弟能够快乐的生活，哪怕放弃爵位也在所不惜。
而第二点在于公主，每一次说起萧瑾瑜的死时候，她似乎都在回想着一些事情。有些人说她很有可能想起了自己的丈夫，也有些人说公主和萧瑾瑜父母之间的关系应该比面有表面上看起来这么简单，最后应该会让人大吃一惊。
