《程序员那么可爱》主要讲述女主为了追爱，女扮男装进入男主公司的爱情故事。人们看女扮男装电视剧的时候，最想要知道的就是女主什么时候恢复女装，毕竟女主的男装看起来并不像男人，还是女装更加漂亮。
陆离是在《程序员那么可爱》第六集的时候恢复女装，并且回到了男主公司上班。对于穿着女装的陆离，其他同事一开始很不适应，后来看到陆离只是变成了女人，但性格等方面并没有变化，才重新接受了陆离。陆离恢复女装之后，男主家人也成为了陆离追爱路上的助攻手，有了男主家人的帮助，陆离之后顺利嫁给了男主。
男主曾经被前女友伤害过，所以男主公司不肯招聘女性员工。后来与陆离结婚之后，前女友却回来了，并且前女友还是抱着与男主符合的想法。前女友有钱要投资男主的公司，于是就借用公司合作的目的，整天与男主在一起。男主对前女友并没有什么想法，一心扑在了合作上，于是忽略了陆离的感受，让陆离觉得男主想要与前女友复合。
后来前女友知道了男主与陆离结婚的真相，认为男主是被迫娶陆离，想要救男主逃出婚姻的牢笼，于是前女友就开始向陆离进行打击。陆离一开始就知道前女友在男主心目中的地位，她暗恋男主多年，与男主的感情一直是很没有安全感的状态，于是陆离在听了男主前女友的挑拨之后，主动向男主提出了分手。
男主与陆离相处的过程中，已经慢慢喜欢上了陆离，所以并不同意与陆离分手。前女友看到这样做没有分开两人后，竟然选择开车撞伤陆离。陆离受伤之后，男主才意识到陆离对自己有多重要，于是主动告白，两人幸福收场。
